Управление вычислениями
Цели программы
- Познакомить с Linux контейнерами и Docker;
- Рассказать о различных подходах к автоматизации процесса вычислений и инструментах, реализующих эти подходы
Нашли опечатку?
Write Close
Close
Увидели опечатку? Сообщите нам!
Целевая аудитория
Специалист junior
Длительность программы
32 академических часа
Формат обучения
Дистанционный
Материалы программы
Видеоролики, презентации, тестирования
Преподавательский состав
Антон Брагин
Руководитель группы биоинформатики в компании Parseq Lab
Сергей Морозов
Инженер ИТ-инфраструктуры, Parseq Lab
С отличием закончил ОрелГТУ по направлению "Информационные системы". Имею степень кандидата технических наук по специальности 051306 "Автоматизация технологических процессов и производств". Занимался промышленной автоматизацией и задачами управления вычислительными системами. Есть опыт работы в роли системного инженера. В биоинформатику пришел в 2014 году. Занимаюсь проектами по анализу данных в области Life Science с использованием High Performance и Cloud Computing. Интересуюсь всем, что поможет ученым (биоинформатикам, биологам, химикам и тд.) эффективнее анализировать данные.
1 Введение
1.1 Введение
2 Контейнеризация и Docker
2.1 Знакомство с Docker
2.2 Работа с файлами в контейнерах Docker
2.3 Взаимодействие контейнеров Docker
2.4 Работа с образами Docker
2.5 Технологические основы и роль контейнеризации
3 Workflows и Pipelines
3.1 Работа с данными и пайплайны
3.2 Инструменты пайплайнинга и подходы к описанию пайплайнов
3.3 Snakemake: имплицитное описание графа анализа
3.4 Snakemake: создание пайплайнов
4 Common Workflow Language
4.1 Знакомство с CWL
4.2 Описание инструментов с использованием CWL
4.3 CWL: полезные компоненты
4.4 CWL: создание пайплайнов
5 Заключение
5.1 Заключение
Часто задаваемые вопросы
Вопрос:
Как зайти в сегмент Академии технологий и данных ВШС (АТД)?
Ответ:
Для входа в сегмент АТД (https://atd.sberbank-school.ru/) Вам необходимо знать Ваш логин и пароль. В случае, если Вы не знаете или забыли Ваш логин и (или) пароль, пожалуйста, обратитесь в Службу технической поддержки по адресу atdhelp@sberbank-school.ru
Вопрос:
Могу ли я проходить обучение в сегменте АТД не с рабочего компьютера?
Ответ:
Да, Вы можете зайти в сегмент АТД с любого компьютера, имеющего доступ в Интернет.
Вопрос:
Я могу проходить обучение из "Альфы"?
Ответ:
Нет, для работы в сегменте АТД необходим доступ в Интернет.
Вопрос:
Куда обращаться, если что-то не работает (пароль неверен, не открывается тест, не отображаются материалы и т.п.)?
Ответ:
Обратитесь в Службу технической поддержки по адресу atdhelp@sberbank-school.ru
Made on
Tilda